Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTNP21246 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTNP21246 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTNP21246 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTNP21246 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTNP21246 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTNP21246 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTNP21246 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTNP21246 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTNP21246 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms