Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK11BP21127 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms