Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTF3P20783 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTF3P20783 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NTF3P20783 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NTF3P20783 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NTF3P20783 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NTF3P20783 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms