Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD33P20138 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD33P20138 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD33P20138 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD33P20138 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD33P20138 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD33P20138 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD33P20138 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD33P20138 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD33P20138 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD33P20138 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD33P20138 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD33P20138 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD33P20138 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD33P20138 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD33P20138 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms