Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDSP20132 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SDSP20132 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDSP20132 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDSP20132 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDSP20132 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDSP20132 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDSP20132 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDSP20132 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDSP20132 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDSP20132 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDSP20132 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SDSP20132 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDSP20132 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDSP20132 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDSP20132 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDSP20132 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDSP20132 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDSP20132 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDSP20132 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDSP20132 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDSP20132 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SDSP20132 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSP20132 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDSP20132 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDSP20132 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDSP20132 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDSP20132 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDSP20132 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDSP20132 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SDSP20132 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SDSP20132 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDSP20132 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDSP20132 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDSP20132 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDSP20132 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDSP20132 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SDSP20132 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDSP20132 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDSP20132 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDSP20132 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDSP20132 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDSP20132 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms