Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF2P19878 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF2P19878 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF2P19878 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF2P19878 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF2P19878 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF2P19878 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF2P19878 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCF2P19878 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCF2P19878 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF2P19878 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF2P19878 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF2P19878 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCF2P19878 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF2P19878 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms