Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRAP18433 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRAP18433 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRAP18433 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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