Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB9P17482 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms