Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF3P17036 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms