Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GATA1P15976 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GATA1P15976 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GATA1P15976 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GATA1P15976 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms