Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRAFP15056 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRAFP15056 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRAFP15056 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRAFP15056 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRAFP15056 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRAFP15056 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRAFP15056 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRAFP15056 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms