Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCSHP14314 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCSHP14314 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCSHP14314 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms