Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DOBP13765 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms