Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms