Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2C1P13056 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2C1P13056 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2C1P13056 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2C1P13056 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR2C1P13056 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2C1P13056 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms