Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRM1P11229 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM1P11229 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM1P11229 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms