Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNHG28P0DPA3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNHG28P0DPA3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNHG28P0DPA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms