Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-3P0DP02 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-30-3P0DP02 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms