Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAA2P0DJI9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAA2P0DJI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms