Protein–RNA interactions for Protein: P0CK97

SLC35E2, Solute carrier family 35 member E2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2P0CK97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E2P0CK97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E2P0CK97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E2P0CK97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms