Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2MP0CAP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2MP0CAP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms