Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM253P0C7T8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM253P0C7T8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms