Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
C4AP0C0L4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4AP0C0L4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms