Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT19P08727 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT19P08727 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT19P08727 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT19P08727 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT19P08727 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT19P08727 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT19P08727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT19P08727 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT19P08727 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT19P08727 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT19P08727 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT19P08727 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms