Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPB2P08579 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPB2P08579 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPB2P08579 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPB2P08579 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms