Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSF1RP07333 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSF1RP07333 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms