Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFMP07197 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFMP07197 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFMP07197 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFMP07197 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFMP07197 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFMP07197 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFMP07197 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFMP07197 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NEFMP07197 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NEFMP07197 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFMP07197 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFMP07197 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEFMP07197 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFMP07197 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFMP07197 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFMP07197 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFMP07197 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NEFMP07197 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NEFMP07197 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFMP07197 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFMP07197 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFMP07197 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NEFMP07197 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NEFMP07197 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFMP07197 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFMP07197 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFMP07197 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFMP07197 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFMP07197 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFMP07197 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFMP07197 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NEFMP07197 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEFMP07197 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEFMP07197 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms