Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYBBP04839 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYBBP04839 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYBBP04839 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYBBP04839 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYBBP04839 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYBBP04839 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYBBP04839 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYBBP04839 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYBBP04839 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYBBP04839 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYBBP04839 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYBBP04839 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYBBP04839 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYBBP04839 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYBBP04839 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYBBP04839 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYBBP04839 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYBBP04839 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYBBP04839 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYBBP04839 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYBBP04839 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYBBP04839 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms