Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRM2P04554 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRM2P04554 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRM2P04554 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRM2P04554 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRM2P04554 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRM2P04554 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms