Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC1P02654 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC1P02654 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOC1P02654 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOC1P02654 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC1P02654 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC1P02654 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOC1P02654 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOC1P02654 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOC1P02654 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOC1P02654 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC1P02654 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms