Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX6O95947 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX6O95947 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX6O95947 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX6O95947 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX6O95947 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX6O95947 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX6O95947 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX6O95947 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX6O95947 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TBX6O95947 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TBX6O95947 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX6O95947 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX6O95947 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX6O95947 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX6O95947 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX6O95947 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX6O95947 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX6O95947 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX6O95947 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX6O95947 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX6O95947 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX6O95947 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX6O95947 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX6O95947 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms