Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBX18O95935 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBX18O95935 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBX18O95935 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBX18O95935 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBX18O95935 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBX18O95935 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TBX18O95935 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBX18O95935 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBX18O95935 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBX18O95935 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBX18O95935 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBX18O95935 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX18O95935 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX18O95935 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX18O95935 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms