Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC24BO95487 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms