Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE8BO95263 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE8BO95263 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8BO95263 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms