Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR47O94967 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR47O94967 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR47O94967 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR47O94967 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR47O94967 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR47O94967 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR47O94967 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR47O94967 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR47O94967 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR47O94967 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR47O94967 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR47O94967 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR47O94967 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms