Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRCPO75575 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRCPO75575 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRCPO75575 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRCPO75575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRCPO75575 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRCPO75575 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRCPO75575 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRCPO75575 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRCPO75575 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRCPO75575 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRCPO75575 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRCPO75575 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRCPO75575 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRCPO75575 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms