Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN5O75503 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN5O75503 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN5O75503 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN5O75503 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN5O75503 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLN5O75503 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLN5O75503 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN5O75503 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN5O75503 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLN5O75503 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLN5O75503 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms