Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC45O75419 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC45O75419 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC45O75419 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC45O75419 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC45O75419 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC45O75419 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC45O75419 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC45O75419 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC45O75419 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC45O75419 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC45O75419 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC45O75419 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC45O75419 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC45O75419 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC45O75419 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC45O75419 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC45O75419 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC45O75419 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC45O75419 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC45O75419 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC45O75419 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC45O75419 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC45O75419 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC45O75419 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC45O75419 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC45O75419 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC45O75419 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC45O75419 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC45O75419 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC45O75419 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC45O75419 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms