Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR5O60602 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR5O60602 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR5O60602 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR5O60602 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR5O60602 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR5O60602 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR5O60602 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR5O60602 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR5O60602 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR5O60602 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR5O60602 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR5O60602 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR5O60602 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR5O60602 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR5O60602 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR5O60602 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms