Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD2O60548 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms