Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX15O60248 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX15O60248 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX15O60248 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX15O60248 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX15O60248 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX15O60248 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX15O60248 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX15O60248 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX15O60248 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX15O60248 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX15O60248 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms