Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PLIN1O60240 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PLIN1O60240 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms