Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX1O43933 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX1O43933 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX1O43933 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX1O43933 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX1O43933 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX1O43933 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX1O43933 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX1O43933 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms