Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX6O43752 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX6O43752 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX6O43752 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX6O43752 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX6O43752 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
STX6O43752 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX6O43752 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX6O43752 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX6O43752 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX6O43752 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX6O43752 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX6O43752 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX6O43752 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX6O43752 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX6O43752 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX6O43752 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms