Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN4O43707 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.4 ms