Protein–RNA interactions for Protein: O43548

TGM5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM5O43548 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TGM5O43548 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGM5O43548 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGM5O43548 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGM5O43548 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGM5O43548 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM5O43548 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM5O43548 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM5O43548 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM5O43548 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM5O43548 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM5O43548 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM5O43548 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms