Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF12O43508 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF12O43508 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms