Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERI3O43414 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERI3O43414 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERI3O43414 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERI3O43414 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERI3O43414 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERI3O43414 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERI3O43414 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERI3O43414 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERI3O43414 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERI3O43414 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERI3O43414 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERI3O43414 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERI3O43414 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms