Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1E1O43324 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1E1O43324 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1E1O43324 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1E1O43324 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEF1E1O43324 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1E1O43324 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms