Protein–RNA interactions for Protein: O43294

TGFB1I1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1I1O43294 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TGFB1I1O43294 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1I1O43294 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFB1I1O43294 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms